2025年9月1日，《Industrial Crops & Products》（中国科学院一区Top）在线发表了崔秀明研究员团队完成的题为“Single-cell transcriptome atlas of Panax notoginseng embryonic shoot apex: Insights into developmental regulation and triterpene saponin biosynthesis”的研究论文。该研究通过构建三七茎尖发育的单细胞转录组图谱，系统揭示了三七茎尖的细胞类型、发育轨迹及三萜皂苷生物合成的细胞调控网络。

三七茎尖发育的单细胞转录组图谱

该研究将茎尖细胞划分为7大主要类型，共14个亚群，解析了各细胞簇在发育过程中的基因表达特征及关键转录因子的调控网络。团队鉴定到PTI5和IDD2等是调控茎尖早期发育的关键因子，并发现NAC、bHLH、MYB和ERF等关键转录因子家族在三萜皂苷生物合成中起重要作用，这些转录因子主要在三七茎尖的表皮细胞和叶肉细胞中特异高表达。

调控三七茎尖发育的关键转录因子

该研究首次在单细胞分辨率下揭示了三七茎尖的细胞发育与三萜皂苷生物合成之间的细胞异质性，为阐释三七地上部分形态建成的分子基础及次生代谢产物积累提供了新视角，也为通过遗传改良提升三七药材品质奠定了理论基础。2025年8月,《Horticulture Research》（中国科学院一区Top）在线发表了崔秀明研究员团队完成的题为“Integrated single-cell transcriptomics and spatial metabolomics unveil cellular differentiation and ginsenosides biosynthesis in Panax root tips” 的研究论文，首次对人参属三个物种（三七、人参、西洋参）的根尖进行了单细胞转录组测序和空间代谢组学的联合分析(https://www.kmust.edu.cn/info/1141/51352.htm)。

我院三七重点实验室崔秀明研究员团队已毕业硕士生刘梅和已毕业博士生杨丽芳为论文共同第一作者，刘源副教授和杨野教授为论文共同通讯作者。本研究得到了云南省重大科技专项计划，国家自然科学基金和国家重点研发项目的资助。全文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0926669025013664